Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssrp1Q08943 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms