Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms