Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms