Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms