Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MestQ07646 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MestQ07646 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MestQ07646 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MestQ07646 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MestQ07646 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MestQ07646 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MestQ07646 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MestQ07646 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MestQ07646 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MestQ07646 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MestQ07646 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MestQ07646 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MestQ07646 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MestQ07646 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MestQ07646 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MestQ07646 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MestQ07646 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MestQ07646 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MestQ07646 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MestQ07646 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MestQ07646 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MestQ07646 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MestQ07646 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MestQ07646 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MestQ07646 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MestQ07646 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MestQ07646 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MestQ07646 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MestQ07646 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MestQ07646 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MestQ07646 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MestQ07646 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MestQ07646 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MestQ07646 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MestQ07646 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MestQ07646 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MestQ07646 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MestQ07646 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MestQ07646 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MestQ07646 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MestQ07646 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MestQ07646 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MestQ07646 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MestQ07646 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MestQ07646 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MestQ07646 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MestQ07646 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MestQ07646 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MestQ07646 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MestQ07646 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MestQ07646 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MestQ07646 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MestQ07646 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MestQ07646 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MestQ07646 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MestQ07646 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MestQ07646 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MestQ07646 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MestQ07646 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MestQ07646 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MestQ07646 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MestQ07646 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MestQ07646 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MestQ07646 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MestQ07646 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MestQ07646 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MestQ07646 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MestQ07646 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MestQ07646 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MestQ07646 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MestQ07646 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MestQ07646 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MestQ07646 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MestQ07646 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MestQ07646 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MestQ07646 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MestQ07646 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MestQ07646 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MestQ07646 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MestQ07646 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MestQ07646 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MestQ07646 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MestQ07646 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MestQ07646 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MestQ07646 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MestQ07646 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MestQ07646 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MestQ07646 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MestQ07646 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MestQ07646 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MestQ07646 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MestQ07646 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MestQ07646 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MestQ07646 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MestQ07646 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MestQ07646 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MestQ07646 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MestQ07646 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MestQ07646 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms