Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Col17a1Q07563 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms