Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn3Q07409 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms