Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prrx2Q06348 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Prrx2Q06348 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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