Protein–RNA interactions for Protein: Q059Y8

Dcst1, E3 ubiquitin-protein ligase DCST1, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcst1Q059Y8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcst1Q059Y8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dcst1Q059Y8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dcst1Q059Y8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dcst1Q059Y8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dcst1Q059Y8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dcst1Q059Y8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dcst1Q059Y8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dcst1Q059Y8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dcst1Q059Y8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dcst1Q059Y8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dcst1Q059Y8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms