Protein–RNA interactions for Protein: Q05306

Col10a1, Collagen alpha-1(X) chain, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col10a1Q05306 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col10a1Q05306 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms