Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top1Q04750 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Top1Q04750 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top1Q04750 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top1Q04750 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top1Q04750 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Top1Q04750 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Top1Q04750 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top1Q04750 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top1Q04750 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top1Q04750 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top1Q04750 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms