Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms