Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms