Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcr5Q04683 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms