Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms