Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms