Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms