Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GscQ02591 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GscQ02591 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GscQ02591 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GscQ02591 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GscQ02591 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GscQ02591 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GscQ02591 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GscQ02591 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GscQ02591 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GscQ02591 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GscQ02591 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GscQ02591 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GscQ02591 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GscQ02591 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GscQ02591 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GscQ02591 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GscQ02591 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GscQ02591 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GscQ02591 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GscQ02591 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GscQ02591 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GscQ02591 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GscQ02591 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GscQ02591 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GscQ02591 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GscQ02591 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GscQ02591 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GscQ02591 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GscQ02591 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GscQ02591 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GscQ02591 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GscQ02591 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GscQ02591 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GscQ02591 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GscQ02591 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GscQ02591 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GscQ02591 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GscQ02591 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GscQ02591 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GscQ02591 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GscQ02591 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GscQ02591 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GscQ02591 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GscQ02591 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GscQ02591 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GscQ02591 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GscQ02591 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GscQ02591 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GscQ02591 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GscQ02591 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GscQ02591 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GscQ02591 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GscQ02591 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GscQ02591 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GscQ02591 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GscQ02591 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GscQ02591 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GscQ02591 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GscQ02591 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GscQ02591 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GscQ02591 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GscQ02591 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GscQ02591 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GscQ02591 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GscQ02591 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GscQ02591 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GscQ02591 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GscQ02591 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GscQ02591 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GscQ02591 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GscQ02591 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GscQ02591 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GscQ02591 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GscQ02591 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GscQ02591 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GscQ02591 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GscQ02591 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GscQ02591 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GscQ02591 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GscQ02591 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GscQ02591 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GscQ02591 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GscQ02591 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GscQ02591 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GscQ02591 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GscQ02591 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GscQ02591 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GscQ02591 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GscQ02591 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GscQ02591 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GscQ02591 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GscQ02591 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GscQ02591 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GscQ02591 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GscQ02591 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GscQ02591 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GscQ02591 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GscQ02591 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GscQ02591 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms