Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnb1Q02248 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnb1Q02248 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnb1Q02248 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnb1Q02248 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnb1Q02248 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnb1Q02248 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnnb1Q02248 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnnb1Q02248 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnnb1Q02248 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnnb1Q02248 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnnb1Q02248 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnnb1Q02248 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms