Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms