Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VcpQ01853 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VcpQ01853 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VcpQ01853 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VcpQ01853 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VcpQ01853 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VcpQ01853 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VcpQ01853 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VcpQ01853 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms