Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms