Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms