Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms