Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms