Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms