Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeleQ00690 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeleQ00690 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeleQ00690 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeleQ00690 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeleQ00690 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeleQ00690 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeleQ00690 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeleQ00690 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeleQ00690 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeleQ00690 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SeleQ00690 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms