Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms