Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms