Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb4P99026 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms