Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Shc1P98083 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shc1P98083 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shc1P98083 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shc1P98083 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms