Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smn1P97801 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smn1P97801 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smn1P97801 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smn1P97801 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smn1P97801 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smn1P97801 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Smn1P97801 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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