Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AlkP97793 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AlkP97793 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AlkP97793 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
AlkP97793 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AlkP97793 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AlkP97793 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AlkP97793 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AlkP97793 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AlkP97793 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AlkP97793 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AlkP97793 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AlkP97793 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AlkP97793 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
AlkP97793 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AlkP97793 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AlkP97793 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AlkP97793 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
AlkP97793 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AlkP97793 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AlkP97793 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AlkP97793 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AlkP97793 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AlkP97793 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AlkP97793 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AlkP97793 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AlkP97793 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AlkP97793 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AlkP97793 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AlkP97793 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AlkP97793 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AlkP97793 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AlkP97793 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AlkP97793 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AlkP97793 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AlkP97793 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AlkP97793 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AlkP97793 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AlkP97793 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AlkP97793 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AlkP97793 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AlkP97793 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AlkP97793 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
AlkP97793 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AlkP97793 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AlkP97793 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AlkP97793 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AlkP97793 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AlkP97793 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AlkP97793 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AlkP97793 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
AlkP97793 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AlkP97793 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AlkP97793 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AlkP97793 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AlkP97793 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AlkP97793 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AlkP97793 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AlkP97793 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AlkP97793 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AlkP97793 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AlkP97793 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AlkP97793 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AlkP97793 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AlkP97793 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AlkP97793 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AlkP97793 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AlkP97793 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AlkP97793 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AlkP97793 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AlkP97793 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
AlkP97793 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AlkP97793 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AlkP97793 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AlkP97793 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AlkP97793 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AlkP97793 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AlkP97793 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AlkP97793 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
AlkP97793 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AlkP97793 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AlkP97793 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AlkP97793 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AlkP97793 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AlkP97793 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AlkP97793 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AlkP97793 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AlkP97793 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AlkP97793 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AlkP97793 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AlkP97793 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AlkP97793 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AlkP97793 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AlkP97793 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AlkP97793 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AlkP97793 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AlkP97793 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AlkP97793 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AlkP97793 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AlkP97793 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms