Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms