Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms