Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf1P84078 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf1P84078 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf1P84078 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf1P84078 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf1P84078 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf1P84078 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Arf1P84078 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf1P84078 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf1P84078 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf1P84078 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Arf1P84078 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms