Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms