Protein–RNA interactions for Protein: P80313

Cct7, T-complex protein 1 subunit eta, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct7P80313 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cct7P80313 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cct7P80313 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cct7P80313 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cct7P80313 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cct7P80313 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cct7P80313 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cct7P80313 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cct7P80313 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cct7P80313 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cct7P80313 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cct7P80313 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cct7P80313 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms