Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx2P80206 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx2P80206 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx2P80206 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx2P80206 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx2P80206 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx2P80206 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx2P80206 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms