Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms