Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad50P70388 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad50P70388 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad50P70388 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad50P70388 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad50P70388 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad50P70388 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad50P70388 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad50P70388 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad50P70388 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad50P70388 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad50P70388 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad50P70388 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad50P70388 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad50P70388 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad50P70388 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad50P70388 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad50P70388 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad50P70388 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad50P70388 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad50P70388 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad50P70388 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad50P70388 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad50P70388 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad50P70388 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad50P70388 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad50P70388 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad50P70388 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad50P70388 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad50P70388 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad50P70388 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad50P70388 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad50P70388 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms