Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms