Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx3P70354 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx3P70354 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx3P70354 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms