Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad1P70340 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad1P70340 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad1P70340 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad1P70340 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad1P70340 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms