Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cux2P70298 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cux2P70298 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cux2P70298 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cux2P70298 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cux2P70298 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cux2P70298 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cux2P70298 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux2P70298 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux2P70298 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
Cux2P70298 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Cux2P70298 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cux2P70298 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cux2P70298 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cux2P70298 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms