Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms