Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms