Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms