Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acta1P68134 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acta1P68134 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acta1P68134 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acta1P68134 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acta1P68134 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms