Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpnP63163 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpnP63163 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpnP63163 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpnP63163 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpnP63163 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpnP63163 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpnP63163 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpnP63163 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpnP63163 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpnP63163 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpnP63163 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpnP63163 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpnP63163 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpnP63163 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpnP63163 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpnP63163 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpnP63163 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpnP63163 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpnP63163 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpnP63163 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpnP63163 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms